Des commissions techniques composées d'experts techniques sont créées lors de chaque session ordinaire du Congrès. Leur fonction est de passer en revue les progrès scientifiques et technologiques et de formuler des recommandations sur des normes internationales relatives aux méthodes, procédures, techniques et pratiques en matière de météorologie et d'hydrologie opérationnelle à inclure dans les règlements techniques, guides et manuels.
Les Membres de l'OMM ont le droit de se faire représenter au sein des commissions techniques.
L'OMM compte actuellement deux commissions techniques:
La Commission des observations, des infrastructures et des systèmes d'information (Commission des infrastructures ou INFCOM), qui couvre les observations, données et systèmes de prévision du système Terre coordonnés au plan mondial
La Commission des services et applications météorologiques, climatologiques, hydrologiques, maritimes et environnementaux (Commission des services ou SERCOM), qui couvre les services et applications de la météorologie, de l'hydrologie et des domaines connexes se rapportant aux activités humaines et harmonisés à l'échelle mondiale.