المجلس التنفيذي هو الهيئة التنفيذية للمنظمة العالمية للأرصاد الجوية، ويُعنى بتنفيذ قرارات المؤتمر. ويتولى المجلس تنسيق البرامج، وإدارة الميزانية، وينظر في القرارات والتوصيات المقدمة من الاتحادات الإقليمية واللجنتين الفنيتين، ويتخذ إجراءات بشأنها، ويدرس كذلك المسائل التي تؤثر على الأرصاد الجوية الدولية والأنشطة ذات الصلة بها، ويقدم توصيات بشأنها. وتُعقَد دورات المجلس التنفيذي مرة كل عام، وعادة ما تكون في جنيف. ويتخذ المجلس قراراته بأغلبية ثلثي الأصوات.
ويتألف المجلس من رئيس، وثلاثة نواب للرئيس، وستة رؤساء للاتحادات الإقليمية، و27 مديراً للمرافق الوطنية للأرصاد الجوية أو الأرصاد الجوية الهيدرولوجية ينتخبهم المؤتمر. ولكل عضو من أعضاء المجلس صوت واحد فقط. ولمزيد من المعلومات عن أعضاء المجلس التنفيذي، والأفرقة العاملة وأعضائها، وأنشطة المجلس، يرجى الرجوع إلى المنصة التفاعلية للمنظمة العالمية للأرصاد الجوية.