El Departamento de Ciencia e Innovación moviliza a la comunidad investigadora internacional para potenciar la comprensión del sistema Tierra, desarrollar los ámbitos científicos pertinentes para la formulación de políticas y mejorar el ciclo de valor que pone la ciencia al servicio de la sociedad. El director de este departamento es el señor Jürg Luterbacher, quien además ostenta el cargo de director científico de la Organización Meteorológica Mundial (OMM).
El Departamento de Ciencia e Innovación se encarga de las siguientes labores: